Subtropisch in den südwestlichen Ebenen, sonst kontinentales Klima. Die Temperaturen in Duschanbe liegen zwischen -12°C im Dezember/Januar und 30 °C im Juli/August. Die Luftfeuchtigkeit ist im Allgemeinen niedrig. In den Bergen fallen die Temperaturen auf bis zu -50°C und erreichen im Sommer höchstens 20°C.